Il chiostro è il cortile interno del convento delimitato ai lati da un porticato , al centro c’è il pozzo con la sottostante cisterna che garantiva l’approvvigionamento dell’acqua ; era il luogo ideale per fare due passi senza uscire dalla clausura, scambiare qualche parola con i confratelli o meditare al riparo dalle distrazioni del mondo esterno .

Il porticato del chiostro è sorretto da colonne ottagonali in cotto con basamenti e capitelli in arenaria ; sul lato settentrionale , quello che corre lungo il fianco della chiesa, troviamo cinque lunette affrescate con episodi relativi alla vita di San Girolamo .